扩散型与繁殖型松材线虫数字基因表达谱对比分析

摘要：

[目的]松材线虫作为林业重大外来入侵种,扩散型幼虫的形成对其传播扩散起着非常重要的作用,但扩散虫态的形成与维持机制尚未阐明.[方法]通过构建松材线虫数字基因表达谱(DGE),从滞育状态的维持、化学感受、代谢途径等方面分析松材线虫不同虫态的基因表达差异.[结果]参考松材线虫基因组数据,鉴定出2种扩散型幼虫(LⅢ,LⅣv)和繁殖型幼虫(Ln)各有11184、8533和10781个基因.相对于繁殖型虫态,大多数基因在LⅣ中下调表达,该虫态中特异上调表达的基因有化感受体基因、核受体基因以及一些代谢相关基因.推测这可能与扩散型线虫滞育状态的维持相关,并在其生理功能如化学感受和媒介/寄主互作中发挥作用.GO和Pathway富集分析显示,多数代谢相关通路在LⅣ中下调表达,而在LⅢ中的表达均活跃.[结论]以上结果与LⅣ处于不进食、总体代谢水平较低等生理状态的表型相一致.

关键词：松材线虫、扩散型虫态、数字基因表达谱、差异表达基因

所属期刊栏目：26

分类号：TH7;R13

资助基金：林业公益性行业科研专项201204501;国家自然科学基金31572272,31272323;中国科学院创新工程项目KSCX2-EW-J-2;中国科学院前沿科学重点研究项目QYZDB-SSW-SMC014;国家高技术研究发展计划“863”2014AA020529

在线出版日期：2017-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：111-121