支持向量机和邻接法在夜蛾科昆虫条码研究中的应用

摘要：

[背景]鳞翅目夜蛾科昆虫种类繁多,目前已经超过3.5万种,绝大多数是农林生产的主要害虫.由于多数近缘属种形态相似,难以鉴定,给农林害虫的防治工作带了很大的困难.DNA条形码技术是一种快速、准确鉴定物种的方法.支持向量机作为一种新的机器学习方法,自1995年被提出以来已经在数据分类和高维模式识别等领域取得不错的效果.[方法]将北京妙峰山采集的58种夜蛾101个样品的COI序列分成3套数据集,分别通过邻接法和支持向量机对其进行验证.[结果]通过对DNA条形码物种鉴定结果的验证表明,邻接法优于支持向量机.但DNA条形码在鉴定夜蛾科的一些近缘种上,效果不佳,如棉铃虫和烟青虫.[结论与意义]DNA条形码作为一种新兴的物种鉴定方法,在分类学上具有很高的应用价值.通过邻接法和支持向量机的比较,虽然支持向量机的成功率低于邻接法,但是其在DNA条形码中的应用是对数据问询方式的一种探索.

关键词：DNA条形码、夜蛾科、支持向量机、邻接法、近缘种

所属期刊栏目：21

分类号：TP3;S76

资助基金：北京市自然基金重点项目KZ201010028028;北京市人才强教项目PHR201107120;国家自然科学基金项目31071963、31272340、31272355

在线出版日期：2013-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：308-314