16S rRNA基因在微生物生态学中的应用

摘要：

16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中.近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于16SrRNA基因的研究使得微生物生态学得到了快速发展,然而使用16S rRNA基因作为分子标志物时也存在诸多问题,比如水平基因转移、多拷贝的异质性、基因扩增效率的差异、数据分析方法的选择等,这些问题影响了微生物群落组成和多样性分析时的准确性.对当前使用16S rRNA基因分析微生物群落组成和多样性的进展情况做一总结,重点讨论当前存在的主要问题以及各种分析方法的发展,尤其是与高通量测序技术有关的实验和数据处理问题.

关键词：16S rRNA基因、微生物群落、多样性、高通量测序、生物信息数据处理

所属期刊栏目：35

分类号：X17;S71

资助基金：国家重点基础研究发展规划资助项目2013CB733502;国家自然科学基金资助项目41371268,31300447

在线出版日期：2015-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共20页

页码：2769-2788