基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析
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10.5846/stxb201301250159

基于RFLP技术的鹿角杯形珊瑚共附生固氮菌多样性分析

引用
对三亚湾鹿回头与西沙石岛的常见鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)的固氮酶nifH基因多样性进行了分析,并对其共附生固氮微生物多样性进行了比较.利用TaqI和HaeⅢ两种限制性内切酶分别对三亚湾珊瑚的粘液(SYN)、组织(SYZ)和西沙珊瑚组织(XSZ)的阳性克隆子进行聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,得到了23,25和13个OTUs,文库的覆盖率分别为90.3%,87.5%和94.1%,多样性指数Shannon-Wiener指数(H)分别为2.28,3.02和2.08,Evenness指数(E)分别为0.5,0.65和0.56.研究结果表明:1)3个文库重要组成部分都是绿菌门(Chlorobia)和变形菌门(Proteobacteria)α-亚门、γ-亚门、δ-亚门细菌;2)3个文库绝大部分OTUs的最相似序列来自珊瑚礁、海绵、水体、沉积物等环境中的不可培养细菌,反映鹿角杯形珊瑚组织和粘液可能蕴含着丰富的尚未被培养的固氮菌资源;3)发现了两大重要的类群——分别与绿菌门和脱硫弧菌属(Desulfovibrio)细菌序列最相似的类群,它们通过为珊瑚共生体提供有机氮源参与到珊瑚白化的调节或恢复过程中,在珊瑚共生体营养物质的循环中充当重要角色;4)从多样性指数分析可以看出,SYZ的固氮微生物多样性高于SYN,SYZ的固氮微生物多样性高于XSZ,反映了鹿角杯形珊瑚生活的地理位置不同,固氮菌共附生的生态位不同(如珊瑚粘液、组织等不同部位),都将导致珊瑚共附生固氮菌多样性的差异.

鹿角杯形珊瑚、固氮菌、固氮酶基因nifH、PCR-RFLP、生物多样性

34

P74;S51

国家自然科学基金项目41276113,41276114,41006069;国家高技术研究发展计划项目2012AA092104,2013AA092901,2013AA092902;中国科学院战略性先导科技专项AXDA11020202;三亚市院地科技合作项目2013YD74;国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金201304

2015-10-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共12页

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