醉马草免培养内生细菌的多样性

摘要：

为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库.对筛选到249个克隆进行Hae Ⅲ酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs).系统发育分析将其归为4个门:变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群.其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16SrRNA基因序列相似性(97%-100%),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacteriumspp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富.另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%.研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群.

关键词：醉马草、内生细菌、免培养法、生物多样性

所属期刊栏目：31

分类号：S43;S85

资助基金：973计划前期研究专项2008CB417214;新疆特殊环境微生物实验室开放课题XJYS0203-2009-02

在线出版日期：2015-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2178-2187