核糖体小亚基V4和V9区引物扩增大亚湾真核浮游生物的比较研究

摘要：

对大亚湾水体的环境DNA分别进行18S rDNA的V4和V9区的引物扩增,通过高通量测序技术进行测序,并比较分析二者浮游真核生物基因多样性和相对丰度.18S rDNA V4区引物扩增共检测出浮游动物56纲,101目,浮游植物52纲,69目;18S rDNA V9区引物扩增共检测出浮游动物47纲,81目,浮游植物56纲,101目.两对引物对浮游真核生物扩增都具有较高覆盖度,在纲级别上二者的结果相近:颚足纲(Maxillopoda)是浮游动物优势类群;甲藻纲(Dinophyceae)、圆筛藻纲(Coscinodiscophyceae)、小豆藻纲(Mamiellophyceae)是浮游植物优势类群,其中甲藻纲多样性与丰度的结果相近,而18S rDNA V9区引物扩增得到的圆筛藻纲丰度高于18S rDNA V4区引物.分析结果表明,18S rDNA V4区引物扩增的浮游动物多样性比18S rDNA V9区引物高,而18S rDNA V9区引物扩增的浮游植物多样性比18S rDNA V4区引物高.同时,通过高通量测序技术首次确定大亚湾海区大量存在着寄生型甲藻(Syndiniales),小豆藻目(Mamiellales).

关键词：高通量测序、真核浮游生物、基因多样性、浮游植物、浮游动物、大亚湾

所属期刊栏目：42

分类号：Q178.53;Q7(水生生物学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广州海洋实验室人才团队引进项目

在线出版日期：2023-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：242-251