天然及人工红树林土壤微生物群落结构分析

摘要：

应用高通量测序和OTU分析法比较了红树植物人工修复区(Transplant-,TP)与天然区(Natural-,NA)土壤微生物的群落结构差异.结果显示:从群落组成来看,细菌在天然林和人工林主要由27个门类的菌群组成,优势菌群包括变形杆菌(Proteobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)、绿弯菌(Chloroflexi)、酸杆菌(Acidobacteria)、浮霉菌(Planctomycetales).古菌的组成在纲的水平上主要以盐杆菌(Halobacteria)、热原体(Thermoplasmata)和甲烷菌(甲烷微菌Methanomicrobia、甲烷杆菌Methanobacteria、甲烷球菌Methanococci)为主,其中盐杆菌占的比重最大(约19%—37%).从结构来看,多样性指数(H)和丰富度指数(Schao)表明:天然林和人工林细菌的多样性和丰度均高于古菌,天然林多样性及丰度均高于人工林(NA>TP).此外,对采集的样本进行主成分分析(PCA)显示细菌聚成两大类:源自外周土壤的菌群聚成一类,源自根际土壤的菌群聚成另一类;古菌则按生境聚成三类:分别是天然林、人工林和采自非红树区的基围鱼塘.对细菌来说,经长时间修复的人工林与天然林的外周土壤群落结构差异不大,显示出了趋同性;但同一环境下的根际与外周土壤群落结构差异较大,体现了明显的根际效应.古菌结构受根际效应的影响较小,受环境因素影响较大.

关键词：天然林、人工林、土壤微生物、群落结构、根际效应、秋茄

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分类号：Q938.1(微生物学)

资助基金：国家海洋局公益性行业科研专项201305021;广东省海洋渔业科技与产业发展专项计划A201503D07;深圳市科技创新委员会基础研究计划JCYJ20150529164918736

在线出版日期：2017-12-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

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