盐度胁迫对幼体大海马基因转录表达的影响

摘要：

为探究大海马(Hippocampus kuda Bleeker)幼体在高盐、低盐胁迫条件下的基因表达水平的变化规律,对实验条件下的大海马幼体的肝脏样品进行了转录组测序.对照组(CK,25‰)、高盐(HS-test,31‰)和低盐(LS-test,17‰)胁迫组共获得71794个单基因簇(Unigenes),N50为1780 bp,平均长度为820.71 bp.高盐胁迫组与对照组比较,共获得2740个差异表达基因(DEGs),其中495个DEGs上调,2245个DEGs下调;与对照组相比,低盐胁迫组共获得3715个DEGs,其中1854个DEGs上调,1861个DEGs下调.高/低盐胁迫组DEGs经KEGG数据库富集发现,高/低盐度胁迫均能导致大海马幼体体内氨基酸代谢、免疫代谢、能量和脂肪酸代谢相关基因受到影响.其中,低盐胁迫时能量代谢和氨基酸代谢的相关基因显著上调,高盐胁迫时脂肪酸代谢的相关基因显著下调,而高/低盐胁迫时免疫代谢的相关基因都显著上调.从经过盐度胁迫的大海马幼体的肝脏转录组中分别筛选到免疫相关基因Gst、Hsp70、Hsp90、Sod、Bcl-2、Gadd45α、Terβ、Tap2和Traf3,脂肪酸代谢相关基因Fadsd6、Fas、Sqle、 Cyp51、Elovl6和Slc27a6,能量代谢相关基因Vlcad、Pdha1、Mdh1、Idh3b、G6pd和Sdhd,及一些氨基酸代谢相关基因Gldc、Atp6v1e1、Sms、Fadh、Asl、Ass1和Glud1等,可作为大海马幼体响应环境盐度变化应激的候选基因.研究结果为盐度胁迫下大海马幼体的稳态调控机制的研究奠定了一定基础,有助于在养殖实践中预防极端的盐度改变对大海马幼体所造成的影响.

关键词：大海马;盐度胁迫;转录组测序;差异表达基因

所属期刊栏目：45

分类号：Q344+.1(遗传学分支学科)

资助基金：宁波市自然科学基金;教育部重点科技项目;宁波大学学科开放基金

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：995-1004