池蝶蚌STAT基因的克隆及功能分析

摘要：

为了探究池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)信号转导及转录激活因子STAT基因的初步功能,通过RACE-PCR技术首次在池蝶蚌中获得STAT的cDNA全长序列(GenBank ID:KY123702),命名为HsSTAT,HsSTAT全长为2752 bp, 5′-非编码区(5′UTR)为121bp, 3′-非编码区3′UTR为264 bp, 开放阅读框(ORF)为2367 bp, 编码788个氨基酸; 生物信息学分析发现该蛋白结构域主要由STAT_int、STAT_alpha、STAT_bind、SH2四个经典保守性功能域组成; 缬氨酸最多占12.9%.色氨酸使用频率为100%.二级结构中α螺旋最多占46.83%、β折叠最少占8.5%.HsSTAT蛋白亲水性指数为- 0.531, 是亲水性蛋白.预测到棕榈酰化修饰位点1个, 小泛素相关修饰序列3个, 磷酸化修饰位点22个.系统进化树分析显示, HsSTAT与光滑双脐螺STAT5B和盘鲍STAT5聚在一支;亚细胞定位结果显示HsSTAT定位于血细胞的细胞质中;荧光原位杂交结果显示HsSTAT主要在细胞核.qPCR结果显示HsSTAT在所有的组织中均有表达, 其在组织中的表达量在肝胰腺中最高, 在血细胞中最低.细胞增殖实验显实验组增殖率为119%,高于对照组.实验已克隆到HsSTAT的全长序列,HsSTAT可能为STAT5亚型, 具有促进SMCC-7721细胞增殖的功能, 推测具有池蝶蚌细胞的信号转导功能参与池蝶蚌的先天免疫.

关键词：池蝶蚌、HsSTAT、生物信息学分析、亚细胞定位、荧光原位杂交、qPCR、细胞增殖

所属期刊栏目：42

分类号：Q718(生物大分子的结构和功能)

资助基金：十三五国家贝类产业技术体系淡水珍珠贝养殖与育珠岗CAR-49;国家自然科学基金31660337;江西省科技落地计划项目KJLD12001;江西省教育厅一般项目GJJ150166资助[Supported by the National Shellfish Industrial Technology System Freshwater Pearl Oyster Culture and Cultivate Pearl Post during the 13th Five-Year Plan PeriodCAR-49;the National Natural Science Foundation of China31660337;Science and Technology Landing Projects of Jiangxi ProvienceKJLD12001;the General Found Project of Jiangxi Provincial Education DepartmentGJJ150166]

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：284-292