草鱼野生与选育群体线粒体DNA控制区D-loop遗传变异分析

摘要：

为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,研究对4个野生群体(邗江、九江、石首和吴江)和2个选育世代(F1和F2)进行了线粒体DNA控制区(D-loop)序列的遗传变异分析.实验结果表明,4个野生群体在单倍型数目(H)、单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(π)、平均核苷酸差异数(K)水平上均高于2个选育世代,在2个选育世代内表现为F1代群体的核苷酸多样性(π)和平均核苷酸差异数(K)大于F2代群体,但单倍型多样性(Hd)小于F2代群体;单倍型分析结果表明,6个群体间无共享单倍型,4个野生群体间共发现2种共享单倍型(Hap1和Hap3),石首群体和2个选育世代共享1种单倍型(Hap15);遗传分化指数(Fst)分析结果表明,邗江、九江、吴江3个野生群体和2个选育世代间存在较大的遗传分化(Fst范围为0.41475—0.55128),石首群体与F1代群体之间存在较小的遗传分化,与F2代群体之间存在中等水平的遗传分化,同时F1代群体与F2代群体之间存在较小的遗传分化;基于6个群体276个个体构建的邻接(Neighbor-Joining,NJ)进化树和基于27种单倍型构建的单倍型网络图也得到了相似的结论,即邗江、九江、吴江3个野生群体和2个选育世代间的亲缘关系较远,石首群体和2个选育世代两两之间的亲缘关系较近.以上结果表明,经过2个世代的选择育种,选育群体的遗传结构已发生了变化,并且随着选育的进行,选育世代的遗传多样性下降的较为明显,这警示着我们在今后的育种工作中应适当改变现有的选育方案,并实时监测选育群体的遗传多样性,以便为今后进一步的选育工作打下坚实的基础.

关键词：草鱼、选育群体、野生群体、mtDNA、D-loop、遗传变异

所属期刊栏目：41

分类号：Q349+.1(遗传学分支学科)

资助基金：现代农业产业技术体系CARS-46-04;上海市工程中心提升项目16DZ2281200;通威产学研项目TW2014F003资助Supported by the the China's Agricultural Research SystemCARS-46-04;the Project of Shanghai Engineering and Technology Center for Promoting Ability16DZ2281200;Tongwei Industry-university-research ProjectTW2014F003

在线出版日期：2017-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：947-955