DNA条形码在淡水红藻中的应用评价——基于串珠藻科植物

摘要：

研究采用4种DNA序列,分析了各片段序列特征以及在串珠藻科植物中种属水平的鉴定能力,包括线粒体COI-5P、cox2-3 spacer序列,以及叶绿体rbcL、UPA序列.结果表明,COI-5P、cox2-3 spacer、UPA以及rb-cL序列的PCR扩增成功率分别为96%、100%、96%和98%.其中,COI-5P、cox2-3 spacer和UPA的片段大小符合标准DNA条形码的判定标准,即片段大小在300—800 bp,能够通过单对引物双向测序获得.系统发育分析的结果显示,这4种DNA片段在串珠藻属植物的鉴定中能够鉴定大部分的种类,但COI-5P、cox2-3 spacer以及rbcL序列均不能将两种中国特有种洪洞串珠藻B.hongdongense和长柄串珠藻B.longipedicellatum与弧形串珠藻B.arcuatum分开.在种水平的鉴定中,UPA基因的种间差异最大,显示了较好的分离效果,在串珠藻科植物的鉴定中可以作为一个标准的DNA条形码.

关键词：DNA条形码、串珠藻科、分子系统发育、红藻门

所属期刊栏目：41

分类号：Q949.29(植物学)

资助基金：the National Natural Science Foundation of China31370239, 31440026;the PhD Start-up Fund of TYUST20132013

在线出版日期：2017-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：643-651