基于18S rDNA遗传距离与GC含量对游走类纤毛虫的分子系统学研究

摘要：

为了揭示游走类纤毛虫的系统发生,对寄生于淡水鱼类的车轮虫科中的6种车轮虫进行了18S rDNA的测序并获得了9个序列.采用了最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)对GenBank中所有游走类纤毛虫的18S rDNA序列进行了系统树的构建,并首次将SPSS与18S rDNA遗传距离结合分析了游走类纤毛虫的系统发生.研究结果进一步证实了车轮虫属(Trichodina)的非单系发生与小车轮虫属(Trichodinella)的有效性.此外,研究结合18S rDNA的GC含量与遗传距离分析提出了游走类纤毛虫科属及种间新的鉴定依据:18S rDNA的GC含量可用于游走类纤毛虫的科属区分,且与游走类纤毛虫的分化密切相关;18S rDNA的遗传距离在游走类纤毛虫的不同阶元中具有一定的阈值范围,即通常种内遗传距离阈值范围为0.000-0.005,属种间阈值范围为0.005-0.150,当遗传距离大于0.150时,则达到了科间水平.

关键词：系统发生、18S rDNA、车轮虫属、小车轮虫属、GC含量、遗传距离

所属期刊栏目：40

分类号：Q959.116(动物学)

资助基金：The National Natural Science Foundation of China31101637,31172068,31471980;the project of Chongqing Science & Technology CommissionCSTC,2010CA1010,cstc2014jcyjA80008;the Science Research Foundation of the Education Committee of ChongqingKJ1400530

在线出版日期：2016-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：358-369