基于16S rDNA和COⅠ基因序列探讨四种溞类的系统关系和分类地位

摘要：

为了检验已记录的4个溞属种类(隆线溞Daphnia carinata 溞、透明 D. hyalina 溞、蚤状 D. pulex和大型溞D. magna)的系统分类,用试剂盒法分别提取4种溞类的基因组DNA。利用特异性引物,通过PCR扩增了4种溞属种类的16S rDNA和COⅠ基因部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的同种序列进行分析。结果表明,基于16S rDNA和COⅠ基因,4个溞属种类的平均种间相似度分别为85.56%和80.67%,碱基中A+T含量均明显高于G+C含量。基于COⅠ基因,溞巢湖隆线与来自GenBank 溞上的拟同形(Daphnia similoides AB549199)相似度为99%,分歧度为0.4%-0.9%。就16S rDNA和COⅠ基因而言,溞巢湖透明更溞接近于盔形(Daphnia galeata)。基于16S rDNA和COⅠ基因构建的NJ树和贝叶斯树,两者的主要分枝基本一致。结果暗示,溞溞巢湖隆线与拟同形为一个种,溞溞透明应属于盔形。由于缺乏核基因的研究,有关巢湖溞属的分类地位还需进行更深入的探讨。

关键词：溞属、16S rRNA、COⅠ基因、系统分类

分类号：Q951+.3(动物学)

资助基金：国家自然科学基金31370470

在线出版日期：2014-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1040-1046