池蝶蚌致雄性化基因fem-1c及其蛋白分子的结构特征分析

摘要：

研究首次获得淡水珍珠贝池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)的致雄性化基因feminization-1C亚型,即fem-1c基因,并进行全长克隆及序列分析。从转录组中Race-PCR扩增fem-1c基因全长cDNA序列,用生物信息学方法对 fem-1c 基因进行基因组结构分析、多序列同源性比较、跨膜区段、亲疏水性分析、功能结构域预测等。研究结果如下：该cDNA序列全长2328 bp,包含一个1869 bp的最大开放阅读框,编码622个氨基酸,经同源比对和进化树分析, fem-1基因c亚型编码的氨基酸与太平洋牡蛎的同源性最高,为79%；疏水性分析显示该蛋白为亲水性蛋白；二级结构预测发现该蛋白有大量的α螺旋和随机卷曲,形成9个锚蛋白重复序列(Ankyrin repeat, ANK),同时,三级结构预测中可以清楚的看到9个ANK模体,跟SMART预测的结构位点结果相近。从无脊椎动物到脊椎动物 fem-1c 基因的保守性表明它们有共同的起源,暗示这个基因家族在功能上具备保守性,推测池蝶蚌fem-1c基因可能具备与线虫fem-1基因在性别决定方面上相似的功能。

关键词：池蝶蚌、fem-1c基因、克隆、序列分析、结构预测

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金31160534;江西省科技落地计划12001;江西省科技支撑计划项目20112BBF60013,20121BBF 60036;江西省自然科学基金20122BAB204016;江西省教育厅科技项目GJJ12020

在线出版日期：2014-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1002-1007