凝胶条带内DNA回收测序评估DGGE可靠性
为了评估DGGE的可靠性,对DGGE条带中回收的DNA片段进行了测序比较分析,并引入了DGGE可靠性指数的概念评价其可靠性。结果显示同一条DGGE条带回收的DNA来自同一属的概率为64.7%,相同位置的DGGE条带可以被认为是同一OTU;不同的DGGE条带回收到类似的DNA序列(16S rDNA V3区差异小于4 bp)的概率为10.5%;DGGE可靠性指数为74.8%。以上结果表明尽管DGGE技术与理论预期存在一定的差距,但是DGGE技术基本能够反映微生物群落的多样性。
DGGE可靠性指数、DNA指纹、变性梯度凝胶电泳、微生物群落结构
Q-331(生物科学的研究方法与技术)
国家重点基础研究发展计划2009CB118705;国家自然科学基金30970358,31071896
2014-06-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共5页
454-458