斑节对虾溶菌酶基因克隆及序列分析

摘要：

参考对虾溶菌酶基因和类溶菌酶基因及其他多种生物的溶菌酶基因序列,设计并合成引物.运用RT-PCR技术,从斑节对虾血细胞总RNA中扩增获得特异性片段.所获片段回收纯化后克隆到pGEM-T Easy Vector系统的T载体上.重组子的序列分析表明,所克隆的斑节对虾溶菌酶基因片段长658bp,包括溶菌酶基因开放阅读框(ORF)477bp和3′端非编码区的181bp.477bp ORF共编码158个氨基酸,包括溶菌酶成熟肽140个氨基酸残基和信号肽18个氨基酸残基.斑节对虾溶菌酶成熟肽推测分子量为16,32kd,等电点为8.78.与南美白对虾溶菌酶基因的碱基序列及推测氨基酸序列比较,同源性分别为89.5%和93.0%;与日本对虾类溶菌酶基因的同源性分别为84.0%和91.0%.进一步的序列分析表明,斑节对虾溶菌酶氨基酸序列与多种类群生物的 c-型溶菌酶氨基酸序列具有较高的同源性,并具有与c-型溶菌酶相同的活性位点氨基酸残基 Glu51和 Asp68,且与活性位点相邻的序列高度保守.斑节对虾溶菌酶氨基酸序列还具有与c-型溶菌酶相同的结构氨基酸--8个半胱氨酸残基.因而可认为所克隆的斑节对虾溶菌酶基因属c-型溶菌酶基因.

关键词：斑节对虾、溶菌酶、克隆、序列分析

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分类号：S945.4(水产保护学)

资助基金：广东省自然科学基金20010673

在线出版日期：2004-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：413-417