10.19790/j.cnki.JCM.2023.16.02
人恶性T细胞扩增序列1在肾透明细胞癌预后中作用及其与免疫浸润关系
目的 探讨肾透明细胞癌组织中的人恶性T细胞扩增序列 1(MCTS1/MCT1)表达情况及其与肾透明细胞癌临床病理参数之间的关系,通过各种生物信息学工具预测MCTS1 靶基因及进行相关功能分析,为进一步研究MCTS1 为靶点的基因治疗提供理论依据.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取肾透明细胞癌患者的表达谱和临床信息.应用 Wilcoxon秩和检验,比较肾透明细胞癌组织和正常肾组织中MCTS1 的表达水平.为挖掘潜在的信号通路和生物学功能进行了功能富集分析.免疫细胞浸润采用单样本基因集富集分析.应用 UALCAN和 MethSURV数据库分析MCTS1 的甲基化状态.采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析确定MCTS1 的预后价值.构建诺模图预测肾透明细胞癌 1、3 和 5 年的总生存率(OS).采用 Log-rank检验对P 值进行检验.结果 基于 HPA数据库分析肾透明细胞癌中MCTS1 的组织表达水平,MCTS1 在肾透明细胞癌组织中的表达水平高于邻近组织,差异有统计学意义,P＜0.001;在不同的亚组中,用Kaplan-Meier方法评估MCTS1 表达在肾透明细胞癌患者中的预后价值,结果显示,MCTS1的组织表达水平与 M病理分期、组织学类型和年龄增长密切相关,差异有统计学意义,P＜0.001;当MCTS1 的过度表达时 OS显著下降,差异有统计学意义,P＜0.001;多因素Cox分析确定MCTS1 是 OS 的独立阴性预后标志,合成了符合指数为 0.841 的 OS 诺模图,差异有统计学意义,OR=2.574,95%CI 为 1.446～4.683,P=0.005.UALCAN 和MethSURV数据库分析MCTS1 的甲基化状态,MCTS1 的低甲基化状态与不良预后相关,肾透明细胞肿瘤组织在启动子处的DNA甲基化水平明显低于正常肾脏组织,差异有统计学意义,P＜0.001.单样本基因集富集分析结果显示,MCTS1 的过度表达与自然杀伤细胞、辅助性 T细胞 17、肥大细胞和浆细胞样树突状细胞的免疫细胞浸润水平呈负相关,差异有统计学意义,P＜0.001.结论 MCTS1 高表达是肾透明细胞癌预后的一个独立不利因素,与肾透明细胞癌侵袭性的临床特征和不利的免疫浸润密切相关,为进一步研究MCTS1 为靶点的基因治疗提供理论依据.
人恶性T细胞扩增序列1、肾透明细胞癌、甲基化、免疫浸润、生物信息学
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R737.11(肿瘤学)
国家自然科学基金;贵州省高层次创新人才项目;贵阳市科技计划;贵州省科技计划;贵州省中医药管理中医药;民族医药科学技术项目
2023-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
822-829
