基于转录组学的多组学分析腐败希瓦氏菌冷适应的机制

摘要：

该文基于转录组(high-throughput transcriptome sequencing,RNA-seq)分析腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)ATCC8071在低温下基因表达的差异性.结果表明,在低温条件下,S.putrefaciens中 2142个基因的表达具有明显差异,其中对S.putrefaciens低温冷适应机理起重要的作用基因大量集中于脂肪酸代谢、能量代谢相关通路中.进一步对S.putrefaciens差异基因联合低温条件下脂质组学与蛋白组学数据进行分析,结果表明,在低温下S.putrefaciens基因的差异在不同基因表达层面都表现出明显的一致性,表明脂肪酸代谢与能量代谢的改变对S.putrefaciens冷适应贡献的机制.

关键词：腐败希瓦氏菌(Shewanellaputrefaciens)、冷适应、转录组学、脂肪酸代谢、能量代谢、多组学联合分析

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分类号：Q939.9;R2-03;S601

资助基金：上海城建职业学院教育科学研究项目cjky202302

在线出版日期：2023-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：184-192