基于全基因组测序平均核苷酸一致性的生胞梭菌(Clostridium sporogenes)鉴定

摘要：

基于全基因组测序通过平均核苷酸一致性鉴定生胞梭菌(Clostridium sporogenes)CICC 10385(=CMCC 64941)至种水平.通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 10385的基础信息,并采用BGISEQ-500基因测序仪进行全基因组测序分析全基因组平均核苷酸一致性.结果显示,菌株CICC 10385的基因组大小为4252276 bp,含有58个contigs,基因组(G+C)mol％为27.9％.该菌16S rRNA基因序列与生胞梭菌(C.sporogenes)、肉毒梭菌(C.botulinum)、孔氏梭菌(C.combesii)和C.tepidum最为相似,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)分析显示,该菌与生胞梭菌(C.sporogenes)DSM 795T(GCA 001020205.1)ANI值为99.39％,与梭菌属其余菌种ANI值均低于95％,可将CICC 10385鉴定为生胞梭菌(C.sporogenes).基于全基因组测序的ANI分析是一种准确有效的菌种鉴定方法,为该菌及梭菌属(Clostridium sp.)相关菌种鉴定研究提供了理论依据,为该菌的生物学功能研究奠定了基础.

关键词：生胞梭菌、CICC 10385、CMCC 64941、全基因组测序、平均核苷酸一致性

所属期刊栏目：48

分类号：R733.3;Q93-331;S858.28

资助基金：国家微生物资源共享服务平台项目NIMR-2021

在线出版日期：2022-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：44-49