不同核酸提取方法用于环介导等温扩增检测大西洋鲑鱼的比较分析

摘要：

环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)已被广泛应用于鱼类真伪鉴定.LAMP扩增成功的重要前提是获得高质量的核酸.目前为止,DNA提取方法种类繁多,但对适用于LAMP的提取方法缺乏全面的研究.该研究采用十二烷基磺酸钠(sodium dodecyl sulfonate,SDS)、Tagliavia、Heating以及2种常用市售试剂盒(Takara,Tiangen),对4种前处理的大西洋鲑鱼组织进行DNA提取,并对DNA得率、纯度、LAMP等方面进行比较分析.结果表明,这5种提取方法从不同前处理的样品中获得的DNA均可用于LAMP反应,采用琼脂糖凝胶电泳及荧光可视化检测都可观测到阳性结果.但在实时LAMP检测中,不同提取方法和不同样品前处理方式的Ct值均存在着极显著差异(P<0.01).SDS和Tiangen这2种提取方法虽然DNA得率较低,但可获得高纯度的DNA,并在LAMP反应中有着更低的检测限.该研究结果为大西洋鲑鱼组DNA的提取和检测以及适用于LAMP技术的不同提取方法的研究提供了参考依据.

关键词：环介导等温扩增、大西洋鲑鱼、核酸提取、灵敏度

所属期刊栏目：48

分类号：S858.3;R446.5;Q52

资助基金：国家自然科学基金31701668

在线出版日期：2022-06-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：240-246,254