豆科家族中的木糖异构酶基因分析

摘要：

通过生物信息学方法研究豆科植物中木糖异构酶基因家族分类、系统进化关系.从美国国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)网站筛选出34条豆科植物木糖异构酶基因序列,利用WoLF PSORT、MEME、NCBI、ExPASy、PredictProtein以及MEGA等软件分析豆科植物的木糖异构酶基因的亚细胞定位、基序(Motif)、保守区、一级结构、二级结构和进化树.结果表明:从豆科植物中共筛选出34条木糖异构酶基因序列,大部分的序列长度在1410～1440 bp;亚细胞定位的主要位置在线粒体、细胞质、内质网;Motif分析显示,34个不同物种中的木糖异构酶可以分为15类Motif;一级结构分析显示,大部分氨基酸的分子质量的范围是52952.24～54793.33 Da,等电点的范围为pH 5.52～7.95;二级结构数据显示,无规则卷曲的占比最高;进化树分析显示,34个蛋白序列在进化树上有5个可信度高的分支.研究结论为深入研究豆科植物中木糖异构酶基因的功能奠定了理论基础.

关键词：生物信息学、豆科植物、木糖异构酶、亚细胞定位、进化树

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资助基金：江苏省自然科学基金项目BK20150087

在线出版日期：2020-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：23-27