基于DGGE和Illumina MiSeq技术解析恩施地区米酒细菌多样性

摘要：

以10个恩施地区米酒为研究对象,采用变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)与MiSeq高通量技术对其细菌多样性进行了评价.DGGE结果表明,恩施地区米酒中的细菌主要为Weis-sella、Enterococcus、Pediococcus、Kosakonia和Lactobacillus.MiSeq高通量测序结果表明,米酒中的细菌属主要为隶属于Firmicutes的Pediococcus、Enterococcus、Weissella,以及隶属于Proteobacteria的Kosakonia和隶属于Bacte-roidetes的Prevotella,其平均相对含量分别为58.03％、10.72％、8.24％、3.34％和2.01％.在分类操作单元(op-erational taxonomic units,OTU)水平上,发现了6个核心OTU,其中OTU5646(隶属于Pediococcus)的平均含量为54.74％.采用传统纯培养技术共分离出17株乳酸菌,其中11株鉴定为Pediococcus pentosaceus.由此可见,Pediococcus为恩施地区米酒样品中的优势细菌.

关键词：米酒、细菌多样性、变性梯度凝胶电泳、MiSeq高通量测序

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资助基金：湖北省自然科学基金计划项目2016CFB527

在线出版日期：2019-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：41-46,62