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10.13995/j.cnki.11-1802/ts.015452

陕西关中地区羊乳中细菌多样性的分析

引用
为全面了解羊乳中细菌多样性,对陕西关中地区杨凌、宝鸡和渭南3个牧场羊乳样品中微生物宏基因组DNA的16S rRNA基因V3-V4区进行扩增、高通量测序.研究共获得225 424条高质量序列,平均每个样品聚成673个OTUs.对不同地区羊乳中细菌群落构成分析显示,所有羊乳样品中细菌门有27种,Proteobacteria为陕西关中地区羊乳中的优势菌群门,在渭南地区所占比例最高,为91.15%,在杨凌和宝鸡地区分别占62.44%和60.33%;细菌属有354种,Enterobacter是关中地区羊乳中的优势细菌属,3个地区所占比例分别为37.41%、33.82%和2.87%;细菌种有826种,P.aeruginosa为陕西关中地区的优势菌株,在3个地区分别占1.17%、0.81%和21.8%,且渭南地区的P.aeruginosa含量显著高于其他两个地区.不同地区羊乳样品细菌群体间的多样性分析表明,杨凌和宝鸡这两个地区羊乳中细菌群落丰富度和多样性较高,渭南地区羊乳中细菌群落丰富度和多样性较低.3个地区间羊乳中细菌分布有一定的差别,但样品之间微生物群落结构差距不大,有一定的相似性.

羊乳、细菌多样性、高通量测序

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陕西省科技成果转化专项资金2016KTCG01-12;“中央高校基本科研业务费专项资金资助”GK201603097,GK201703063;陕西省科技计划项目2012K02-06,2016NY-207

2018-04-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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