GenBank数据库中微生物rDNA序列准确性研究

摘要：

rDNA序列同源性分析是目前常用的一种微生物分子鉴定方法。在该方法中,待鉴定微生物的rDNA序列需要与GenBank数据库中的相关序列进行同源性比对,从而得出该菌株的具体种属。从GenBank数据库中收集了细菌16S rDNA序列、丝状真菌ITS序列以及酵母26S rDNA D1/D2区域序列共88条,通过BLAST比对和构建系统发育树的方法对所收集rDNA序列的准确性进行了验证。结果发现有17条序列（19.3%）的长度过短,无法提供足够的系统发育信息;5条序列（5.6%）存在错误命名或测序不准确问题;58条序列（65.9%）没有相关文章发表;62条序列（70.4%）无法获取对应的微生物保藏物。从而提示了GenBank数据库的有限参考价值,在微生物分子鉴定过程中需要对相关rDNA序列的准确性进行验证。

关键词：微生物鉴定、GenBank数据库、rDNA序列、准确性

所属期刊栏目：38

分类号：Q936(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金;教育部科技基础条件平台

在线出版日期：2012-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：28-31