风干肉中产脂肪酶瑞士乳杆菌TR13全基因组测序及序列分析

摘要：

瑞士乳杆菌TR13是从自然风干羊肉中分离筛选到的1 株产脂肪酶活性高的菌株,为能够更好地研究该菌株在羊肉发酵过程中的代谢机理和功能,采用PacBio Illumina HiSeq测序平台对细菌TR13进行完成图测序分析.结果表明,瑞士乳杆菌TR13基因组为1 套环状无质粒分子,基因组序列总长度为2 172 224 bp,GC含量为36.82％.基因组中预测到2 536 个编码基因,编码基因总长度为1 883 532 bp,平均长度为799.46 bp,平均密度为1.08 个/kb,对应蛋白质平均序列长度为265 aa,占基因组百分比为86.71％.TR13菌株基因组中包含15 个rRNA操纵子和63 个tRNA.预测到可能的毒力基因75 个,耐药基因150 个.编码基因通过GO、COG和KEGG数据库的对比分析,完成了TR13菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释,注释信息可为菌株应用研究提供一定理论依据.

关键词：瑞士乳杆菌、全基因组测序、基因功能注释

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分类号：TS201.3(食品工业)

资助基金：国家自然科学基金地区科学基金项目;"十三五"国家重点研发计划重点专项;内蒙古自治区科技计划项目;内蒙古自治区自然科学基金面上项目;内蒙古自治区高等学校科学研究项目

在线出版日期：2020-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：101-109