芽孢杆菌植酸酶基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

采用PCR技术从Bacillus amyloliquefaciens DSM 1061中克隆到植酸酶的全长基因phyC(1152bp),并将该基因成功克隆到表达载体pET22b(+),经PCR鉴定和DNA测序证明,pET22b(+)-phyC重组质粒构建成功.将该酶的氨基酸序列在Swiss-prot数据中进行BLAST比对发现,该序列未见报道,其与来自Bacillus subtilis的植酸酶序列(Swiss-prot ID:031097)最相似,序列一致性为98.7%.分析可知该氨基酸序列在位点为128、144、153、257和370处分别变异为Ala、Ile、Ser、Pro和Lys.运用SignalP 3.0服务器对其信号肽进行预测,表明该酶N端1～26个残基可能是信号肽序列.运用SWISS-MODEL服务器进行同源建模,经PROCHECK V3.5软件对其Ramachandran plot、G-factor等进行评价,结果显示结构模型中的键长、键角及二面角的分布及结构合理.该基因已在GenBank上登录(登录号为HM747163).

关键词：植酸酶基因、克隆、同源建模

分类号：Q812(生物工程学(生物技术))

资助基金：江苏省普通高校自然科学研究资助项目09KJB530011

在线出版日期：2014-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：202-206