Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析

摘要：

目的:预测海洋菌Rheinheimera sp.QH分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据.方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等进行分析.结果:KerQH2为S8家族丝氨酸蛋白酶,其分子表面无规则卷曲占比较高,α-螺旋与β-折叠占比较低且多位于酶分子内部.KerQH2具有保守的催化三联体(Asp8、His41和Ser197),催化三联体区域表面静电势为中性.KerQH2催化结构域中含有大量保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,与底物结合有关的序列富含Gly和Ala.KerQH2主要切割疏水性氨基酸Val(V)/ILe(I)和极性氨基酸Cys(C)/Gln(Q)之间形成的肽键.结论:角蛋白酶KerQH2的特殊结构有助于其降解结构复杂角蛋白分子,这可能是海洋菌对海洋寡营养环境的一种适应性.

关键词：角蛋白酶、KerQH2、海洋菌、Rheinheimera sp.、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：Q936(微生物学)

资助基金：山西省自然科学基金;长治医学院科学技术带头人

在线出版日期：2022-05-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：125-130