嗜酸乳杆菌zrx02的plnD基因克隆及生物信息学分析

摘要：

目的:对zrx02嗜酸乳杆菌细菌素编码基因进行克隆与序列分析.方法:对分离出的菌株进行16S rRNA鉴定,并根据已报道的plnD编码产物基因设计引物,以该菌基因组DNA为模板进行PCR扩增和测序,利用Pro Param tool,TMHMM等在线软件对编码蛋白进行生物信息学分析.结果:该菌为嗜酸乳杆菌,命名为嗜酸乳杆菌zrx02,该菌含有plnD基因,通过与GenBank中相关的抗菌素基因进行比对,发现其基因序列与GenBank库中的Lactobacillus plantarumstrain(WP 016526896.1)plnD gene的同源性达到100％.生物信息学分析显示该基因全长355 bp,编码92个氨基酸,相对分子量10.54 ku,理论等电点9.26,该基因编码蛋白是稳定蛋白,不具有明显的跨膜结构,二级结构主要有α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成,三级结构结果显示plnD蛋白模型与Streptococcus pneumoniae中的ComE同源性最高.结论:对嗜酸乳杆菌zrx02 plnD基因的克隆与分析,为进一步探究细菌素的形成机制奠定理论基础.

关键词：嗜酸乳杆菌、细菌素、plnD基因、克隆、生物信息学

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分类号：TS201.3(食品工业)

资助基金：河南省高校重点科研项目18A550006;河南省高校科技创新人才支持计划17HASTIT037;河南科技学院高层次人才科研项目2015016

在线出版日期：2018-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：137-141,226