γ-PGA降解酶系基因pgdS和ggt的克隆及生物信息分析

摘要：

以实验菌株枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis 115基因组为模板,通过PCR技术成功克隆到γ-聚谷氨酸降解酶系基因pgdS和ggt,并进行测序,利用ExPASy-ProtParam tool、Server 3.0 SignalP、TMHMM Server和Tmpred、PSORTB、PredictProtein、Swiss-Model Workspace软件,分别对蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级结构、三维结构建模进行了分析和预测.结果表明:pgdS和ggt基因分别含1242个和1764个核苷酸,分别编码414个和588个氨基酸.PgdS和GGT均为稳定型亲水性蛋白,都存在信号肽,其亚细胞分别定位于胞壁和胞外.GGT在N端存在一个强跨膜区.二级结构分析显示,PgdS和GGT两种蛋白都以L(环)为主,分别占53.27％和52.47％.通过对γ-PGA降解酶系蛋白结构的分析,为日后有效控制γ-PGA合成及相关研究提供参考和理论依据.

关键词：Bacillus subtilis 115、γ-PGA、pgdS基因、ggt基因、生物信息分析

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分类号：TS202.3(食品工业)

资助基金：国家支撑计划项目2012BAD32B08;研究生创新科研资金项目YJSCX2015-356HSD.

在线出版日期：2016-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：190-194