16SrRNA序列分析在沙门氏菌鉴定分型中的应用

摘要：

目的 建立103株28种血清型沙门氏菌16SrRNA 的进化树, 了解沙门氏菌进化关系, 为基于16SrRNA 序列分析对沙门氏菌鉴定分型提供理论基础.方法 使用细菌基因组 DNA 提取试剂盒提取细菌DNA, 聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增16SrRNA 基因片段后进行测序, 将序列提交到Genebank和RDP核糖体数据库进行比对, 下载相关参考序列, 使用MegAlign软件Clustal-V法构建进化树.结果 根据16SrRNA 同源性能够把103株沙门氏菌聚类成不同群, 部分菌株可以鉴定到血清型, 部分菌株可以在血清型内进一步区分, 虽然与传统血清学分型不能一一对应, 但是能形成独立的分型系统.结论 16SrRNA基因序列分析是对沙门氏菌进行鉴定分型及溯源分析的有效方法.

关键词：16SrRNA、进化树、鉴定、分型、溯源

所属期刊栏目：8

分类号：S85;S3

资助基金：山东出入境检验检疫局计划项目SK201618Supported by the Project of Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau SK201618

在线出版日期：2018-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：4153-4160