16S rDNA克隆文库法分析生鲜牛乳中细菌种群的多样性

摘要：

目的：利用16S rDNA基因文库分析法，对生鲜牛乳中微生物的种群多样性进行研究。方法提取生鲜牛乳中总微生物基因组DNA为模板，将扩增到的生鲜牛乳样品的16S rDNA的PCR产物与pMD~18T载体连接，构建其菌群的16S rDNA文库。对随机选取的56个阳性克隆子进行序列测定和BLAST比对。结果文库序列分析表明，有53个克隆子分属3个不同的类群，即厚壁菌类群、变形菌类群和异常球菌-栖热菌类群，其余3个克隆子属于未知类群。其中，优势细菌类群为厚壁菌类群(86%)，在该类群中，尤以无乳链球菌为主要代表，约占所有克隆子的82%；其他类群为γ~变形菌类群(7.1%)和异常球菌-栖热菌门类群(1.8%)。系统发育分析表明，未知类群在分类地位上更接近与厚壁菌类群。结论生鲜牛乳中微生物具有多样性，无乳链球菌为其中的优势种群，同时生鲜牛乳中还存在葡萄球菌等致病菌，或不动杆菌和肠道菌等条件致病菌。

关键词：16S rDNA、克隆文库、生鲜牛乳、种群多样性、致病菌

分类号：X52;S14

资助基金：国家质检总局科技计划项目2011IK228 Fund:Supported by Science and Technology Planning Project of Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine2011IK228

在线出版日期：2014-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：3170-3176