基于微流控芯片的72重单核苷酸多态性族群推断系统的构建
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10.3724/SP.J.1123.2018.01003

基于微流控芯片的72重单核苷酸多态性族群推断系统的构建

引用
建立了常染色体单核苷酸多态性( SNPs)复合检测芯片体系,用于未知个体的族群来源推断.基于前期筛选的74-SNPs组合,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应( PCR)的原理构建 SNPs 的扩增体系,在微流控芯片的每个反应孔内完成一个 SNP的检测,通过高通量 PCR微流控芯片实现了其中 72个 SNPs的同步检测.芯片的扩增由平板 PCR仪完成,反应孔的荧光信号通过激光共聚焦扫描仪检测,最终通过提取的荧光值进行结果分析.使用该芯片检测获得52份样本的 SNPs分型,分型结果的准确率为 100%.以 57个人群的 3 628个样本为参考人群数据库,进行20份样本的族群来源推断,推断结果与样本的实际来源一致.本研究建立的常染色体 72 个SNPs微流控芯片体系可以有效地进行 SNP多态性分析检测,基于参考数据库,20 份检测样本族群推断的准确性为100%.

族群推断、单核苷酸多态性复合体系、微流控芯片

36

O658(分析化学)

国家重点研发计划2017YFC0803501;国家自然科学基金项目81772027;基本科研业务费专项资金项目2016JB039;公安部物证鉴定中心协同创新工作项目2017XTCX01;公安科技成果推广引导计划2016TGYDGAES14.National Key Plan2017YFC0803501;National Natural Science Foundation of China81772027;Fundamental Research Funds2016JB039;Collaborative Innovation Project for Institute of Forensic Science2017XTCX01;Public Security Science and Technology Promotion Guide Plan2016TGYDGAES14

2018-08-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共9页

599-607

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