基于先验算法的AD基因与影像的关联研究

摘要：

阿尔兹海默病(Alzheimer's disease,AD)已成为导致死亡的主要原因之一.AD的早期诊断和干预成为大多数研究关注的焦点.本文针对多个SNP的相互关联,将影像表型和基因变异之间进行关联研究.首先处理ADNI-GO/2期的基因分型数据,提取位于24个AD候选基因中±20Kbp的SNPs;其次处理1515名参与者的MRI图像,得到1515个182×218×182的voxel影像数据,对获得的voxel影像数据进行降维处理,得到1515个61×73×61大小的数据;最后综合SNP数据与voxel数据,进行vGWAS(voxel Genome-Wide Association Study)分析.将关联分析结果应用频繁项集挖掘算法中的先验算法,得到满足覆盖率40％的具有遗传效应且区域覆盖率最大的SNP集合{rs6092321,rs7806,rs386274},本文揭示多个SNP在脑功能结构中的交互作用,对阿尔兹海默症早期诊断有重要意义.

关键词：阿尔兹海默病、先验算法、频繁项集、全基因组关联研究

所属期刊栏目：19

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;黑龙江省自然科学基金;中央高校基本科研业务费专项哈尔滨工程大学项目;教育部人文社会科学研究项目

在线出版日期：2021-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：61-66