基于TCGA等数据库分析TMEM88在肝细胞中的表达水平及其与预后的关系

摘要：

目的 比较跨膜蛋白88(transmembrane protein 88,TMEM88)在正常肝细胞和肝癌肝细胞中的表达情况,并观察其与患者预后的关系.方法 研究基于公共数据库癌症基因组图谱(TCGA)、STRING、cBioPortal和基因表达总览(GEO)等提供的数据,采用Kaplan-Meier、UALCAN、肿瘤免疫估计资源(TIMER)和基因表达谱富集分析(GEPIA)进行分析.结果 TMEM88在肝癌组织中的表达高于相应的正常肝组织.TMEM88在肝细胞癌组织中的表达与预后相关.TMEM88的低表达与肝癌患者的总体生存率、疾病特异性生存率、无进展生存率和无复发生存率有关,特别是在疾病晚期(2级和3级).TMEM88在肝癌细胞中的MCPCOUNTER浸润率、Xcell浸润率和TEDER浸润率呈正相关.结论 TMEM88在肝癌中是一个保护性基因,并促进免疫逃逸,或可作为肝癌的分子标志物,进而指导临床、判断预后.

关键词：生物信息学、跨膜蛋白88、肝癌

所属期刊栏目：36

分类号：R735.2;R473.71;R573

在线出版日期：2023-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：267-281