二代测序技术在社区获得性肺炎病原学诊断中的应用价值

摘要：

目的 研究二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术在社区获得性肺炎(community-acquired pneumonia,CAP)病原学诊断中的应用价值.方法 采用回顾性研究方法,选取武汉市中心医院呼吸与危重症医学科2020年12月至2021年8月采用支气管镜检查收集肺泡灌洗液标本并行NGS送检的64例社CAP患者作为研究对象,对其临床相关资料进行分析,比较NGS技术与其他传统病原学检测手段在诊断CAP患者病原体中的差异.结果 64例肺泡灌洗液NGS送检患者中,阳性55例、阴性9例.NGS有41例患者检出细菌27种,传统细菌培养有17例患者检出细菌6种,NGS细菌检出率显著高于传统细菌培养(64.1％vs.26.6％,P<0.001).NGS有27例患者检出真菌,传统真菌培养31例检出真菌,NGS真菌检出率与传统真菌培养之间无显著差异(42.2％vs.48.4％,P=0.48).NGS检出病毒29例,嗜肺军团菌1例,鹦鹉热衣原体2例,结核分枝杆菌6例,未检出支原体及衣原体;传统病原学检测检出病毒2例,结核分枝杆菌4例,肺炎衣原体2例,未检出鹦鹉热衣原体、嗜肺军团菌、肺炎支原体.结论 NGS可以同时检测细菌、真菌及病毒等非典型病原体,相较于传统病原学检测方法,其检测病原微生物范围广、种类丰富,对CAP患者的病原学诊断具有重要意义,但检出病原体仍需结合临床分析以确定其是否为致病菌.

关键词：二代测序、社区获得性肺炎、病原学

所属期刊栏目：36

分类号：R725.6;R56;R378.911

资助基金：武汉市卫生健康委医学科研项目WX20Q11

在线出版日期：2023-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：261-266