全基因组DNA甲基化芯片数据批次效应的评价

摘要：

DNA甲基化芯片已广泛应用于癌症研究.但是有研究表明批次效应对基于高通量数据的研究有很大影响.癌症基因组计划 (TCGA)数据库包含大量的不同批次的高通量甲基化数据.通过分析TCGA中7种癌症的数据,发现批次效应在各种类型的癌症数据中都广泛存在,可能会导致错误的生物学分析结论.最后,建议用一个简单的方法来避免批次效应.

关键词：TCGA、批次效应、甲基化芯片

所属期刊栏目：24

分类号：R318.04(医用一般科学)

资助基金：国家自然科学基金;黑龙江省杰出青年科学基金

在线出版日期：2011-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：142-144