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10.16862/j.cnki.issn1674-3873.2020.01.020

榛子SBP基因家族鉴定及其系统进化和表达分析

引用
SBP蛋白是植物所特有的一类转录因子,并广泛存在于植物中.研究发现,该基因家族成员参与响应包括植物生长、发育和抗逆等生物学过程,其功能研究具有重要意义.榛子是一种主要以果实为产品的重要经济林木,且该物种SBP基因家族的研究也未见报道.本研究以生物信息学手段为基础,结合转录组数据,从中筛选得到10个榛子SBP-like基因(SPL基因),并对其编码蛋白理化性质、保守区域和模体进行预测和分析,进而对基因家族进化关系和花发育不同时期表达水平进行了分析.结果表明:榛子的10个SPL基因可以分为5个大组群;均含有该基因家族所特有的C3H和C2CH结构域以及一个核定位信号;同时,基于花发育不同时期的转录组数据分析,部分成员在不同时期表达水平存在显著差异,预示该基因可能与花果发育有关.该研究将有助于榛子SPL基因参与其花果发育分子调控机制的深入研究.

榛子、SBP基因家族、基因鉴定、系统进化、表达分析

41

Q37;S664.4(植物遗传学)

国家自然科学基金项目31770723,31370683

2020-03-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

114-120

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吉林师范大学学报(自然科学版)

1674-3873

22-1393/N

41

2020,41(1)

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