松材线虫Bx-ubc-3基因克隆及泛素通路鉴定

摘要：

泛素途径可以调节许多关键的细胞功能.为探究松材线虫中是否存在泛素途径以及泛素途径中的关键酶基因—泛素结合酶基因ubc3,构建松材线虫cDNA文库,并进行测序、ORF分析、同源性分析、系统发育树构建、蛋白相互作用预测和分子动力学模拟等工作.克隆到长度为957bp的Bx-ubc-3基因片段.随后的序列分析表明,其开放阅读框长度为738 bp,编码245个氨基酸;氨基6酸同源性分析结果表明,Bx-UBC-3与已知的泛素结合酶高度同源;蛋白互作和分子对接分析及分子动力学模拟结果表明,Bx-UBC-3的结合位点位于一个α螺旋、一个Loop1(L1)环与一个Loop2(L2)环;形成硫酯的Cys103位于L2上,构成催化裂隙;Bx-UBC-3和Bx-Rbx1之间以及Bx-UBC-3和Bx-泛素之间形成氢键.这些结果表明松材线虫中存在一条理论泛素通路,其中的关键酶Bx-UBC-3是开发高效抗线虫生物药剂的潜在靶标.

关键词：松材线虫、泛素结合酶3、E2、泛素途径

所属期刊栏目：35

分类号：S763.11(森林保护学)

资助基金：国家重点研发计划资助2018YFC1200402;国家自然科学基金项目31570637

在线出版日期：2019-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15