兔病毒性出血症病毒YM株衣壳蛋白基因的克隆和中国分离株的遗传变异分析

摘要：

应用RT-PCR的方法从某兔场病死兔肝脏组织中分离到RHDV,命名YM株.克隆出衣壳蛋白VP60并测序,测序结果显示VP60全长1 740 bp,编码579个氨基酸.从GenBank下载包括EBHSV、RCV、RHDV共45条序列,运用生物信息学软件分析,构建系统进化树和氨基酸同源性比较,世界不同地区RHDV分离株氨基酸保守性较高,可达94.1％～99.7％,EBHSV与RHDV氨基酸同源性约为75％,而RCV与RHDV的同源性＞90％.系统进化树分析显示,所选的RHDV可分为两个基因群,一组是包括WX-84的经典RHDV群,另一组是抗原变异RHDVa群,包括了除WX/84其余所有的中国分离株.总的来说RHDVa已经替代经典的RHDV在中国流行.

关键词：RHDV、RHDVa、VP60、系统进化树、序列分析

分类号：S829.1;S852.65(家畜)

在线出版日期：2017-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：24-29