巴西橡胶树简单重复序列的鉴定及分离

摘要：

本研究利用巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)这一重要产胶植物的基因组文库进行了简单重复序列(SSRs),也即微卫星序列的分离鉴定.对来自无性系GTl的小插入基因组文库进行SSRs(AC/TG及CT/GA基序)筛选鉴定共获得154个克隆.采用载体通用引物及重复序列进行PCR扩增发现,其中114个为阳性克隆.限制性酶切分析结果显示,这些阳性克隆中有6个为重复拷贝,故予以剔除.之后,对剩余108个克隆中的50个进行了序列分析.此外,试验中对来自优良无性系RRI1105的大插入基因组文库也进行了筛选.所获24个阳性克隆的测序结果也证实了橡胶基因组中微卫星序列的存在.经过最终的序列分析,本研究共鉴定出67个具有不同特点的简单及复合型微卫星序列,其中59个来自GT1,其余8个来自RRI1105.所检测到的重复基序包括二核苷酸(TG/AC,AG/TC,TA/AT),三核苷酸(AAG,AGG,ATT),四核苷酸(GAAA,AAGG,ATCC,TAAA,AAAT),以及一个五核苷酸(GAAAT).与其它作物的报道结果类似,在橡胶基因组中也观察到大量的CT/GA重复.

关键词：巴西橡胶树、简单重复序列、鉴定

分类号：R73;S79

在线出版日期：2011-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

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