Fermitin家族成员1在脑胶质瘤中的表达及其临床意义

摘要：

目的 分析Fermitin家族成员1(FERMT1)在脑胶质瘤中的表达特征,并探讨其临床意义及在脑胶质瘤发生发展中的生物学作用.方法 纳入中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)mRNA测序数据库中309例样本,按照FERMT1表达量分为高表达组和低表达组,分析其表达特征.将癌症基因组图谱计划(TCGA)mRNA测序数据库的609例样本作为对照,验证FERMT1在脑胶质瘤患者中的表达特征.采用Kaplan-Meier法、Log-rank检验和Cox回归模型评价FERMT1表达与脑胶质瘤患者生存期的关系.通过基因本体(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获得FERMT1表达相关基因的功能.结果 在CGGA数据库(309例)和TCGA数据库(609例)中,FERMT1在世界卫生组织(WHO)Ⅱ、Ⅲ及Ⅳ级组间表达量的差异均有统计学意义(F值分别为30.08、91.72,均P<0.01),其中Ⅳ级中表达量最低,Ⅱ级中表达量最高;FERMT1在异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型脑胶质瘤中表达水平更高(t值分别为19.87、30.72,均P<0.01);受试者工作特征(ROC)曲线显示,FERMT1表达量可以很好地预测IDH突变型脑胶质瘤,其曲线下面积(AUC)分别为92.7％和94.8％;FERMT1在四分型组间表达量的差异均有统计学意义(F值分别为94.04、300.20,均P<0.01),其中在前神经元型中表达最高;FERMT1在O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化组的表达量更高,差异有统计学意义(t值分别为6.65、13.41,均P<0.01);在CGGA和TCGA数据库中,FERMT1低表达组患者较高表达组生存期短(P<0.01);单因素和多因素Cox回归分析结果显示,FERMT1表达水平和病理级别为影响胶质母细胞瘤患者预后的独立危险因素(RR=0.718,95％CI:0.517～0.996,P=0.047;RR=2.519,95％CI:1.763～3.599,P<0.001).GO富集分析显示,与FERMT1负相关的基因可能与脑胶质瘤的细胞黏附、细胞外基质组成、炎性反应、白细胞迁移和趋化作用等生物学过程有关.KEGG通路富集分析显示,与FERMT1负相关的基因与细胞骨架调控、黏着斑和细胞外基质受体相互作用等通路相关.结论 FERMT1是可作为判断患者预后的一个潜在指标,可能为胶质瘤的研究和个体化治疗提供一个新的视角.

关键词：胶质瘤、预后、生存期、Fermitin家族成员1

所属期刊栏目：21

分类号：R73;R3;R687.3

资助基金：国家自然科学基金82003193

在线出版日期：2021-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：340-346