AAindex数据库中傅里叶方法的多重氨基酸指数选择

摘要：

波谱学方法研究蛋白质时,蛋白质序列的特征频率与蛋白质的位点、功能、空间结构对应.基于时间序列傅里叶变换的交叉谱原理,本文提出的“一个蛋白质关于多种氨基酸指数的一致谱”能够获取一个或多个蛋白质序列较显著的特征频率,再由特征频率去筛选与之对应的氨基酸指数.该方法与Lazovi(c)的筛选方法和筛选意义不同.结果显示,筛选出的氨基酸指数对应的性质多数与蛋白质的空间结构性质有关.蛋白质特征频率也许是用于特征提取的好方法,氨基酸指数筛选可被看作蛋白质数字表达的一种优化.

关键词：氨基酸指数数据库、傅里叶变换、特征频率、氨基酸指数筛选、信噪比

所属期刊栏目：28

分类号：R857.3(航空航天医学)

资助基金：南京工业大学青年教师基金44204117

在线出版日期：2013-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：643-649