时序基因表达缺失值的加权双向回归估计算法

摘要：

由于受实验条件等客观因素制约,实验所得到的基因表达谱数据存在数据缺失的现象,不利于数据的后续使用.如何在不丢失数据信息、不影响数据整体使用的情况下,对实验数据进行估计、填充已成为目前生物信息学研究的热点.本文通过利用核加权函数提取与缺失值所在的行列具有最大相似性的行列信息,提出了基于双向核加权回归估计的算法.在回归过程中同时考虑基因表达的空间相关性和时问相关性信息,使回归算法使用的信息更加充分.通过与其他缺失值估计算法相比较,加权双向回归算法的估计结果较好.

关键词：时序基因表达、空间相关性、时间相关性、加权双向回归、缺失值估计

所属期刊栏目：28

分类号：Q786;O212;TP391(基因工程（遗传工程）)

资助基金：北京市教育委员会科技计划JC002011200903;水体污染控制与治理重大专项——南水北调中线总干渠水质安全保障关键技术与工程示范2009ZX07212-003

在线出版日期：2013-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：136-140