基于三代测序技术对中药灵芝和食用菌rRNA基因及其基因间序列的鉴定研究

摘要：

目的:基于三代PacBio测序技术,建立中药灵芝和食用菌rRNA 18S-ITS-28S全长序列文库,从分子水平快速、准确鉴定和研究品种.方法:对收集到的8种食用菌和1种中药材真菌灵芝抽提基因组DNA,设计引物扩增18S-ITS-28S全长序列,18S-ITS-28S全长序列包括连续且完整的18S rRNA-ITS1-5.8S rRNA-ITS2和28S rRNA部分序列,其总长度＞3.3 kb.将18S-ITS-28S全长序列进行建库和三代PacBio测序.结果:食用菌和药用灵芝的18S rRNA、5.8S rRNA及部分28S rRNA基因序列相似度高且序列保守,而rRNA基因间(ITS1和ITS2)的序列差异性大.结论:本研究的结果提示,分析rRNA基因间(ITSs)区域,而不是仅仅分析rRNA基因,有助于真菌类中药材的鉴定和研究.

关键词：灵芝、食用菌、rRNA基因、测序分析、鉴定

所属期刊栏目：36

分类号：Q78;Q959.483;Q61

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;上海市分子影像重点实验室建设项目;上海市浦东新区中医治未病高峰学科建设项目;上海市浦东新区学科带头人项目;江苏省南通市科技局科技基金项目

在线出版日期：2023-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：5-12