猪miR-23a-27a-24簇启动子预测及活性分析

摘要：

目的 本研究旨在对猪 miR-23a-27a-24 簇(miR-23a-27a-24 cluster)的潜在启动子区域进行预测和分析,为进一步探索 miR-23a-27a-24 基因对猪转录调控机制的研究奠定基础.方法 利于生物信息学分析猪 miR-23a-27a-24 簇的启动子区域、CpG岛及其潜在的转录因子;利用截短突变和 PCR 技术克隆得到 5 个逐级缺失的 miR-23a-27a-24 基因启动子片段,构建双荧光素酶报告载体,通过检测各载体的双荧光素酶活性获得 miR-23a-27a-24 基因的核心启动子区域.结果 pGL3-cMiR启动子在猪 miR-23a-27a-24 簇上游 341bp至 994bp区荧光素酶活性最强,为 pGL3-basic空载体活性的 5.02 倍(P<0.05),视为 miR-23a-27a-24 簇核心启动区.生物信息学分析表明:猪 miR-23a-27a-24 簇启动子区不含 CpG岛,其核心启动子区可能存在 SP1、VDR、MAZ、YY1、E2F1 和 ELF1六种潜在的转录因子结合位点.结论 本研究构建并确定了猪 miR-23a-27a-24 簇核心启动子区域,可为今后开展猪 miR-23a-27a-24 簇的转录调控机制奠定基础.

关键词：猪、miR-23a-27a-24簇、启动子、转录调控

所属期刊栏目：41

分类号：S828(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;新疆生产建设兵团科技创新人才计划项目;石河子大学动植物育种专项项目

在线出版日期：2023-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：279-285