10.13880/j.cnki.65-1174/n.2021.22.043
小鼠耳芥CONSTANS-like基因家族的鉴定及响应干旱胁迫表达分析
CONSTANS-like家族蛋白是植物光周期途径的转录因子,在植物的生长发育和胁迫应答等过程中起着重要的作用.本研究利用HMMER3.0在小鼠耳芥(Arabidopsis pumila)全基因组范围内进行ApCOL基因家族成员分析,共得到34个ApCOL家族成员.系统进化分为3个亚组,每组ApCOL蛋白质均具有典型的B-box和CCT结构域.亚细胞定位预测结果显示ApCOL成员均定位在细胞核中.基因结构分析表明,ApCOL的外显子、内含子结构和长度在各亚组内具有同一性.26个ApCOL基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)存在共线性关系.ApCOL基因上游启动子序列存在多种光响应、环境胁迫、生长发育以及激素应答等相关顺式作用元件;通过qRT-PCR分析,发现12个ApCOL表达量在PEG6000胁迫下显著上调,暗示这些ApCOL基因参与干旱胁迫响应.本研究丰富了ApCOL家族转录因子的信息,为更好的研究小鼠耳芥生长发育和胁迫响应机制提供一定的参考.
小鼠耳芥;转录因子;COL基因家族;基因表达
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S562(经济作物)
国家自然科学基金项目;石河子大学国际科技合作推进计划项目
2021-12-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共11页
597-607