10.13880/j.cnki.65-1174/n.2016.02.020
小拟南芥双键还原酶基因OpDBR的克隆及表达分析
从小拟南芥,又名无苞芥(Olimarabidopsis pumila,异种名Arabidopsis pumila)幼苗叶片cDNA文库中获得1条与拟南芥烯醛双键还原酶基因AtDBR1(GenBank登录号为NP_197202.2)高度相似的EST序列,该序列包含1个1041 bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码346个氨基酸(GenBank登录号为KU845686).利用RT-PCR技术从小拟南芥叶片的cDNA中克隆了该基因,命名为OpDBR.比对分析结果表明,该基因属于中链还原/脱氢酶(medium chainreductase/dehydrogenases,MDR)超级家族,具有double bond reductase-like保守蛋白结构域;该蛋白的二级结构包含106个α-螺旋和48个β-转角.系统进化树分析结果表明,OpDBR编码产物与预测的亚麻芥烯醛双键还原酶(GenBank 登录号为XP_010492631.1)遗传关系最为接近,属于同一进化分支.实时荧光定量RT-PCR (qRT-PCR)结果显示,OpDBR在小拟南芥的不同组织中都有表达,茎中表达量最高,根中最低.其在200 mmol/L NaCl、4℃、100 μmol/LABA、20%PEG-6000处理下的表达结果分析显示,该基因可能在小拟南芥应对逆境胁迫时起着重要作用.
小拟南芥、无苞芥、DBR、抗逆、基因表达
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Q943.2(植物学)
国家自然科学基金项目U1303302
2016-07-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
251-258