小西葫芦黄花叶病毒石河子分离物的分子变异

摘要：

为了研究小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)石河子分离物的分子变异情况,本研究采用ELISA及一步法RT-PCR对2010-2014年采自石河子地区的30个葫芦科植物样品进行ZYMV检测,从阳性样品中通过一步法RT-PCR克隆其ZYMV分离物的CP基因,经PCR-SSCP分析,将带型一致的ZYMV分离物进行归类,每种类型中选取1个代表性的分离物进行CP基因测序,分析其核苷酸及推导的氨基酸序列的差异.结果显示:2种检测方法的检出率分别为63.33％和83.33％;根据ZYMV CP基因SSCP带型,将21个分离物分为5种不同的类型;其5个代表性分离物的CP核苷酸序列相似性为93.0％-99.8％,在系统进化树中位于2个不同的亚组;氨基酸序列的相似性为96.1％-99.6％,变异主要集中在N端的前41个氨基酸.这表明ZYMV石河子分离物间存在一定程度的分子变异.

关键词：小西葫芦黄花叶病毒、DAS-ELISA、PCR-SSCP、分子变异

所属期刊栏目：33

分类号：S432.412(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目31460466;国际科技合作与交流专项20072072

在线出版日期：2016-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：677-682