基于小麦淀粉合成酶SS Ⅱa氨基酸序列的生物进化分析

摘要：

选取小麦淀粉合成关键酶SS Ⅱa,通过生物信息学分析,探究其在进化过程中与其它生物的亲缘关系,看其是否可以作为生物进化的依据.利用克隆得到的小麦SS Ⅱa基因翻译氨基酸序列,并在NCBI上做BLAST同源比对,并于SwissProt非冗余蛋白数据库获得不同生物的同源氨基酸序列进行生物信息学分析.共比较了47种生物的氨基酸序列,其中包括6种藻类、1种苔藓、1种蕨类、1种菌类和38种陆生被子植物.结果显示:小麦淀粉合成酶氨基酸序列与其它生物的同源性为37％-99％,并表现出较高的保守性.通过构建系统进化树,发现淀粉合成酶氨基酸序列可以大体的反映生物进化关系,其氨基酸序列可以用来判定生物进化过程中亲缘关系的远近.

关键词：氨基酸序列、系统进化树、亲缘关系

所属期刊栏目：33

分类号：S512.1(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金项目31260357

在线出版日期：2015-11-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：405-409