利用转录组测序分析大豆矮小突变体中差异表达基因

摘要：

植株高度是影响农作物产量的重要性状，本实验以大豆矮小突变体为研究材料，发现GA3处理可以部分恢复其矮化表型。为了探究其至矮的分子机制，运用RNA-Seq技术测序分析了野生型和突变体的转录组差异，结果表明有多个与植物激素相关的基因差异表达，其中Glyma19g01590与植物激素GA调节有关，生物信息学分析表明差异表达基因Glyma19g01590的开放阅读框有594 bp，推测编码198个氨基酸，该蛋白具有GASA （Gibberellic Acid-Stimulated in Arabidopsis）保守区域，GASA保守区域与GA调节有关。半定量RT-PCR实验表明Glyma19g01590在突变体中的表达水平明显高于野生型，qRT-PCR实验表明Glyma19g01590在突变体的表达量大约是是野生型的24倍。根据以上结果推测Glyma19g01590基因是导致大豆矮小表型的因素之一。

关键词：矮小突变体、转录组、大豆、GASA保守域

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：新世纪优秀人才支持计划项目NCET-12-1072

在线出版日期：2014-06-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：133-137